В зависимости от потребности микроорганизмов в кислороде в процессе компостирования ферментацию можно разделить на аэробную ферментацию и анаэробную ферментацию.
Преимуществами аэробной ферментации являются высокая скорость ферментации, быстрый нагрев и меньшие потери питательных веществ во время ферментации.
Температура в процессе ферментации может достигать 50-80 градусов, что позволяет уничтожить большое количество микроорганизмов. Это наиболее часто используемый способ в процессе производства.
Анаэробное компостирование - это компост, ферментируемый анаэробными бактериями в анаэробных условиях. При анаэробной ферментации может образовываться большое количество сероводорода, метана и других газов.
Воздуходувки могут использоваться при ферментации навоза домашнего скота и птицы для подачи воздуха для аэробной биологической ферментации.